本件、海外技術部門に確認中となりますが、一点確認させてください。
Acrobat XIでは可能で、Acrobat Xで不可という状況でよろしいでしょうか。
Acrobat Xは初期状態ではSHA256に対応していないため、
10.1以降にアップデートする必要があります。
ACROBAT および Adobe Reader 10.1 リリースノート
http://kb2.adobe.com/jp/cps/866/cpsid_86653/attachments/Acrobat_Reader_ReleaseNote_10.1_jp n.pdf
もしアップデートがかかっていない状態でAcrobat Xをご利用であれば
10.1以降へのアップデートをお試しいただけますでしょうか。